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構造が初めて解かれたタンパク質。
Podophage A1002 (P. aeruginosa)
完全な粒子をクライオ電顕で解析。ノズルが2つのタンパク質に分かれ、尾に6本の鎖状繊維が巻きつく
EIGHT fold knotted proteins (Lachnospiraceae)
X線構造で結び目を確かめ、変性は6段階で進むと分かった
ChOGRE23 G-quadruplex (chicken β-globin origin)
NMRで決めた3層の(3+1)ハイブリッド型で、5'端のGがanti型で外側の層に入る
OmcE cytochrome nanowire (D. soudanensis)
深部地下の塩水に棲む菌のシトクロム線維をクライオ電顕で解き、束の接触面を示した
Flagellar export apparatus (B. burgdorferi)
ライム病菌の細胞内でin situクライオ電顕により解析。膜が大きく曲がり、漏斗状の通り道ができていた
WDR82–PNUTS–Symplekin–Ssu72 (S. pombe)
PNUTSとSymplekinがWD40タンパク質WDR82の別々の面に結合する構造を、X線結晶構造で示した
Hda–β clamp (DnaN) complex (E. coli)
クライオ電顕で4つの状態を解析。八量体では活性中心のアルギニンが埋まる
COCFAT (Capnocytophaga ochracea)
細菌のスルホ脂質をつくるCFATの結晶構造。基質結合型は2.46 Å
Alkaline phosphatase (P. aeruginosa) / proteinase K
クライオ電顕で、緑膿菌ALPのフィラメントとProtKのナノチューブの構造を決めた
SARS-CoV-2 ORF3a-specific TCRs / HLA-A*01:01
SARS-CoV-2 ORF3aペプチドを認識するパブリックTCRとプライベートTCRを約3 Åで比べた
ScMK (S. cerevisiae mevalonate kinase)
5つの阻害剤複合体の結晶構造で、小さなループと側鎖の動きが鎖長の差を吸収していた
DAB1 complex (T. albus)
状態Aは反応物の入口、状態BはHCO3−の出口とみられる通路が開いていた
CAPADH (B. fragilis, C. leptum)
apo結晶構造とSAXSで、NADP+が加わると酵素が閉じた配置になることを示した
Blm10:13S proteasome intermediate (S. cerevisiae)
組み立て中間体5種をクライオ電顕で解き、両者の結合は排他的と分かった
VZV B- and C-capsids (varicella-zoster virus)
B・Cカプシドをクライオ電顕で3.1 Åまで解き、ポータル頂点の違いも調べた
ZIKV NS1–Fab complexes (Zika virus)
5種の抗体との複合体をクライオ電顕で解析し、結合様式を2群に分けた
RdRp of Jingmen tick virus and Alongshan virus
JMTVとALSVのRdRpの結晶構造は、典型的なフラビウイルスと似た形だった
Bat MHC-II (Eptesicus fuscus) with peptides
予測ツールAF-predをコウモリMHC-IIの結晶構造と結合実験で検証した
Enterovirus A71 RdRP (S417G) elongation complex
EV71 RdRPの結晶構造と速度論で、セリン417が通り道をふさぐ様子を示した
Human MGAT1
ヒトMGAT1の結晶構造から、肺がんの免疫回避に関わる酵素の新しい結合部位が見えた
Stk1 kinase (S. aureus)
Stk1と阻害剤GWXの結晶構造は、DFG-out型の不活性な状態を示した
Mouse MPO–anti-MPO Fab complexes
MPOとFabのクライオ電顕で、抗体の結合部位を特定した
Cdr1 (Candida glabrata)
クライオ電顕と3D変動解析で、ポンプが開く動きとイトラコナゾールの収まり方を捉えた
KKT23 (T. brucei)
酵素ドメインの結晶構造はGCN5に最も近く、KKT23を減らすとH2Aのアセチル化が下がった
AshA (Amycolatopsis keratiniphila)
1.11 Åの結晶構造で、ヒスチジンの向きが反応位置を決めると示した
PdpC (F. tularensis subsp. novicida)
3.4 Åのクライオ電顕構造で5つのドメインを示し、PI(3)Pへの結合を調べた
FMDV O/Cathay topotype + porcine antibody pO18-29
ブタ抗体pO18-29との複合体をクライオ電顕で解析し、結合の差を示した
Human OCTN1 (SLC22A4)
ヒトOCTN1のapo型とエルゴチオネン結合型をクライオ電顕で解き、構造に基づく仮想スクリーニングで阻害剤を探した
Human NHA1 (SLC9B1)
精子の運動に関わるNa⁺/H⁺交換体を3.6 Åで解析し、モデルした外向き状態との比較でコア領域の動きを調べた
Vaccinia virus D13 (scaffold)
足場タンパク質D13の2種類の集合体をクライオ電顕で解析し、棒状から格子への移行を示した。
Human cPRC1 (PRC1.4)
ヌクレオソーム結合型のヒトPRC1をクライオ電顕で解析し、PHC2を含む界面の働きを調べた
Human CLN8 (Batten disease protein)
クライオ電顕で活性部位を示し、Batten病の変異は酵素活性を弱めた
Human DNAAF19–RUVBL1/2
クライオ電顕でRUVBL1/2の環にDNAAF19とDPCDが結合する様子を示した
SaMurJ (S. aureus)
外向きと内向きの2状態をクライオ電顕で解析し、大腸菌のMurJと同じ型の動きを示した
Human ciliary transition zone (ECT2L, DZANK1)
気道細胞の中で構造を直接解析し、2遺伝子の変異は原発性線毛運動異常症の原因になる
Pit2 (Ustilago maydis)
Pit2の結晶構造で、リガンドのペプチドは二量体の芯に隠れていた
WzmWzt (M. tuberculosis)
3つの状態をクライオ電顕で解析。ゲートヘリックスの動きが輸送のカギを握る
Human HLA-DR3–Ro60 peptide
自己抗原ペプチドと結合したHLA-DR3の初の結晶構造(2.87 Å)。TCRを組み込んだTregは抑制力が約2倍に
NsRufO (P450)
抗生物質ルフォマイシンの合成で、His-5を介したプロトンの受け渡しが関わる可能性がある
Rho (M. tuberculosis)
NIDを欠くと、Rhoが見つけるRut部位は1759か所から47か所に減った
DNA-PK–nucleosome complex
DNA-PKcsがKuを内側へ押し込む中間状態も、クライオ電顕で捉えた
SpNanR (S. pneumoniae)
全長のapo型とDNA結合型の構造を決定。Arg67の対がDNAの副溝に入り込む