FoldTimes（記事ごと）

緑膿菌ファージA1002は、尾の繊維を2種類のタンパク質で組む

Thu, 05 Nov 2026 09:00:00 +0900

完全な粒子をクライオ電顕で解析。ノズルが2つのタンパク質に分かれ、尾に6本の鎖状繊維が巻きつく

Podophage A1002 (P. aeruginosa)・New Structure・PLOS Biology

2026.11.05 号 No. 01

Doc2Bは、Munc13-1がシンタキシンを開く部位をふさぐ

Thu, 05 Nov 2026 09:00:00 +0900

AI設計の結合タンパク質を使ってクライオ電顕で複合体を解析。膜に結合すると阻害が外れる可能性も示した

Doc2B–Munc13-1 complex・Structure Update・Advanced Science

2026.11.05 号 No. 02

シリンゴリン類縁体は、マラリア原虫のプロテアソームを選んで阻害する

Thu, 05 Nov 2026 09:00:00 +0900

原虫とヒトの20Sプロテアソームとの複合体をクライオ電顕で解き、選択性の手がかりを探った

20S proteasome (P. falciparum, human)・Structure Update・Journal of Medicinal Chemistry

2026.11.05 号 No. 03

ZLC853は、CDK12のCys1039に共有結合する経口薬候補だ

Thu, 05 Nov 2026 09:00:00 +0900

共結晶構造と質量分析で結合を確かめ、前立腺がんのモデルで腫瘍の増殖を抑えた

Human CDK12/Cyclin K・Structure Update・Acta Pharmaceutica Sinica. B

2026.11.05 号 No. 04

設計タンパク質WRAPで包むと、膜タンパク質が水に溶ける

Thu, 05 Nov 2026 09:00:00 +0900

既存構造をもとに設計し、抗酸菌のポリンMspAを包んだ複合体をクライオ電顕で2.95 Å解析した

WRAP-MspA (M. smegmatis porin A)・Structure-Based Study・Science (New York, N.Y.)

2026.11.05 号 No. 05

PAβNは、MexBの空洞で3通りの姿をとる

Wed, 04 Nov 2026 09:00:00 +0900

クライオ電顕と結晶構造でMexB・PAβN複合体を解析し、阻害剤の通り道を探った

MexB (P. aeruginosa)・Structure Update・Frontiers in Pharmacology

2026.11.04 号 No. 01

ニワトリMHC BF2*21:01は、幅広いペプチドに規則を持つ

Wed, 04 Nov 2026 09:00:00 +0900

結晶構造とペプチド解析から、どのペプチドが安定に結合するかを整理した

Chicken MHC class I BF2*21:01・Structure Update・eLife

2026.11.04 号 No. 02

AIで絞った阻害剤候補が、Mac1にたしかに結合した

Tue, 03 Nov 2026 09:00:00 +0900

ドッキングで選んだ化合物とMac1の複合体を1.02 Åの結晶構造で確かめた

SARS-CoV-2 NSP3 Mac1 macrodomain・Structure Update・Scientific Reports

2026.11.03 号 No. 01

ALDH1B1阻害剤の弱点を、構造を手がかりに改良した

Tue, 03 Nov 2026 09:00:00 +0900

複数の複合体の結晶構造で結合の溝を調べ、安定性の高いIGUANA-5を得た

Human ALDH1B1・Structure Update・Journal of Medicinal Chemistry

2026.11.03 号 No. 02

正体不明の電子密度から、AIがタンパク質を絞り込む

Tue, 03 Nov 2026 09:00:00 +0900

AlphaFold2の予測構造を機械学習で順位づけし、未同定のクライオ電顕マップを解析した

CryoAssign (E. coli DnaK and ArnA maps)・Structure Update・bioRxiv

2026.11.03 号 No. 03

GSK3βの結晶構造111件は、8つの状態に分けられる

Tue, 03 Nov 2026 09:00:00 +0900

既存のPDB構造をすべて分類し、リガンドの種類と活性化ループの違いを関連づけた

Human GSK3β・Structure-Based Study・Acta crystallographica. Section D, Structural biology

2026.11.03 号 No. 04

MspAは、周りの脂質のアシル鎖を部分的に整列させる

Sun, 01 Nov 2026 09:00:00 +0900

脂質ナノディスク中の2.5 Åクライオ電顕構造に、32本のアシル鎖が決まった位置で見えた

M2 MspA nanopore (M. smegmatis)・Structure Update・Science Advances

2026.11.01 号 No. 01

C797Sでも効く、EGFRのC775を狙う阻害剤

Sun, 01 Nov 2026 09:00:00 +0900

ZNL-1との共結晶構造でC775への共有結合を確認。C775とC797の両方に結合するYNW-1も設計した

Human EGFR kinase domain with ZNL-1・Structure Update・ACS Central Science

2026.11.01 号 No. 02

液体セルで、室温の水和結晶の構造を決める

Sun, 01 Nov 2026 09:00:00 +0900

炭素膜2枚の簡単な液体セルと低線量の多結晶データで、0.8〜1.0 Åの電子回折構造を得た

KLVFFA peptide (Aβ segment) and hydrates・Structure Update・ACS Central Science

2026.11.01 号 No. 03

ニンヒドリンが、アルギニンを狙う共有結合の弾頭になる

Sun, 01 Nov 2026 09:00:00 +0900

反応性アルギニンを6,800以上分類し、既存のPDB構造を使ってシクロフィリンAを狙う分子を設計した

Reactive arginines; cyclophilin A R55・Structure-Based Study・ACS Central Science

2026.11.01 号 No. 04

環状RNAを作るリボザイムは、一価イオンを足場に活性部位を組み直す

Sat, 31 Oct 2026 09:00:00 +0900

8つのクライオ電顕構造が、分岐からバックスプライシングへ移る金属イオンの入れ替わりを示した

Gdi-1 CP group II intron (G. diazotrophicus)・Structure Update・Nucleic Acids Research

2026.10.31 号 No. 01

細菌のシアリダーゼは、補体のシアル酸を外して免疫を逃れる

Sat, 31 Oct 2026 09:00:00 +0900

T. denticola の NanH を結晶構造と血清殺菌試験で調べ、触媒ドメインの共通性も示した

T. denticola NanH sialidase (GH33)・Structure Update・Protein Science : A Publication of the Protein Society

2026.10.31 号 No. 02

Nur77 のリガンド結合ドメインは、2つの状態で共存している

Sat, 31 Oct 2026 09:00:00 +0900

NMR と変異体解析で、H1–H3 ループ周辺の弱い相互作用網が状態の比率を保つことが分かった

Nur77 (NR4A1) ligand-binding domain・Structure-Based Study・Magnetic Resonance Letters

2026.10.31 号 No. 03

ClpPを遠くから止める、新しい阻害剤

Fri, 30 Oct 2026 09:00:00 +0900

活性部位から約30 Å離れたポケットに結合し、触媒残基の並びをずらして不活性にする

Human mitochondrial ClpP with OICR18704・Structure Update・Nature Communications

2026.10.30 号 No. 01

腸内細菌に、8交差の複雑な結び目をもつタンパク質が見つかった

Fri, 30 Oct 2026 09:00:00 +0900

X線構造で結び目を確かめ、変性は6段階で進むと分かった

EIGHT fold knotted proteins (Lachnospiraceae)・New Structure・Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America

2026.10.30 号 No. 02

ニワトリの複製起点のDNAは、Cが飛び出したG4を作る

Fri, 30 Oct 2026 09:00:00 +0900

NMRで決めた3層の(3+1)ハイブリッド型で、5'端のGがanti型で外側の層に入る

ChOGRE23 G-quadruplex (chicken β-globin origin)・New Structure・Chemistry (Weinheim an Der Bergstrasse, Germany)

2026.10.30 号 No. 03

ウイルスGPCRで、Gq活性化の途中の状態を3つ捉えた

Fri, 30 Oct 2026 09:00:00 +0900

クライオ電顕でE・T2C・C状態を解析し、α5の形成が塩橋の切断を介してGDP放出を促すと提案

HCMV US28–Gq complex with CX3CL1.44・Structure Update・Nature Communications

2026.10.30 号 No. 04

VSVのポリメラーゼは、N0をRNAの出口そばに留める

Fri, 30 Oct 2026 09:00:00 +0900

L-P-N0のクライオ電顕で、N0がLCTD付近を動く様子と3.8 Åの安定な状態を得た

VSV L–P–N0 polymerase complex・Structure Update・Science Advances

2026.10.30 号 No. 05

対称な大腸菌FtsEXが、非対称なEnvCを受け止める

Fri, 30 Oct 2026 09:00:00 +0900

ATP結合状態の構造をクライオ電顕で解析。柔らかいループが相手の形に合わせて結合する

E. coli FtsEX (with EnvC)・Structure Update・eLife

2026.10.30 号 No. 06

HCN2の細胞質ドメインを移したチャネルは、縮んだ形をとる

Fri, 30 Oct 2026 09:00:00 +0900

キメラとCNBD欠失体の構造から、cAMP応答と自己抑制を調べた

Human HCN1/HCN2 chimera (HCN112) and HCN1ΔC channels・Structure Update・The Journal of Biological Chemistry

2026.10.30 号 No. 07

RNAは、cGAMPの異性体を結合の向きで見分ける

Fri, 30 Oct 2026 09:00:00 +0900

リボスイッチ変異体の結晶構造では、2種のcGAMPで塩基が逆向きに入り、A64・G68との接し方が変わる

c-di-GMP-II riboswitch variant (B. halodurans)・Structure Update・Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America

2026.10.30 号 No. 08

サルの抗体は、ヒトの抗体と似た向きでHCVのE2に結合した

Fri, 30 Oct 2026 09:00:00 +0900

BD抗体25種を調べ、RM3-26とE2コアの結晶構造を2.24 Åで決めた

HCV E2 core with macaque antibody RM3-26・Structure Update・Cell Reports

2026.10.30 号 No. 09

抗GFRAL抗体は、GFRALの表面を作り替えてRETをふさぐ

Fri, 30 Oct 2026 09:00:00 +0900

Fab–GFRAL D3の結晶構造（2.3 Å）が誘導適合を示し、悪液質のマウスで効果を確かめた

Human GFRAL D3 with anti-GFRAL Fab (GB2Ab)・Structure Update・Science Advances

2026.10.30 号 No. 10

3-O-硫酸の隣も切れる、腸内細菌のヘパリン酵素

Fri, 30 Oct 2026 09:00:00 +0900

X線結晶構造で切断後の二糖が活性部位に収まる様子を捉え、LC-MSとNMRの結果を裏づけた

Heparin lyase I (B. eggerthii)・Structure Update・Glycobiology

2026.10.30 号 No. 11

DTX4のRINGは、結晶中でドメインを入れ替えた二量体を作る

Fri, 30 Oct 2026 09:00:00 +0900

ADP-リボース結合型のRING-DTCを2.8 Åで解析し、ADP-リボースへの結合も測った

Human DTX4 RING-DTC domains・Structure Update・Biochemical Journal

2026.10.30 号 No. 12

合成した15化合物のうち5つが、PKAをナノモルで阻害した

Fri, 30 Oct 2026 09:00:00 +0900

断片をサブポケットごとに成長させる計算法で設計し、最も強い化合物の結晶構造が予測とよく重なった

PKA catalytic subunit α (C. griseus)・Structure Update・Journal of Chemical Information and Modeling

2026.10.30 号 No. 13

テラゾシンは、PGK1が閉じるのを妨げて開いた状態に保つ

Fri, 30 Oct 2026 09:00:00 +0900

NMR滴定と、NOEだけで決めたNMR²構造が、X線構造と同じ結合部位を溶液中で示した

Human PGK1 (phosphoglycerate kinase 1)・Structure Update・JACS Au

2026.10.30 号 No. 14

二ヘム酵素の電子は、トリプトファンなしでも運ばれる

Fri, 30 Oct 2026 09:00:00 +0900

MbnHの変異体解析で、ヘムのプロピオン酸基を通る別の電子の通り道が見えた

MbnH (M. trichosporium OB3b)・Structure-Based Study・Journal of the American Chemical Society

2026.10.30 号 No. 15

19F–19F NOESYで、タンパク質中の約5 Å以内の距離が測れる

Fri, 30 Oct 2026 09:00:00 +0900

シクロフィリンAに入れた二フッ素化トリプトファンで、F–F距離を小分子のX線構造と比べて確かめた

Human cyclophilin A (CypA)・Structure-Based Study・Chemistry (Weinheim an Der Bergstrasse, Germany)

2026.10.30 号 No. 16

テロメラーゼ阻害剤は、予想外の場所に結合していた